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无损表型数据成长分析中性状的滑润与提取

无损表型数据成长分析中性状的滑润与提取

【概要描述】本文以番茄为试验资料,选取基于性状的滑润和提取(SET)和纵向分析步骤,钻研了接种丛枝菌根真菌(AMF)的泥土中锌(Zn)的增长和成长植物对植株成长的影响。

无损表型数据成长分析中性状的滑润与提取

【概要描述】本文以番茄为试验资料,选取基于性状的滑润和提取(SET)和纵向分析步骤,钻研了接种丛枝菌根真菌(AMF)的泥土中锌(Zn)的增长和成长植物对植株成长的影响。

  • 分类:行业动态
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  • 颁布功夫:2020-03-13 14:48
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无损高通量植物表型分析被越来越多地利用,各类成长分析步骤也被提出。传统的纵向或沉复丈量分析通常使用统计模型来仿照增长。然而,传统的纵向或沉复丈量分析通常使用统计模型来仿照增长。本文提出了一种基于性状的滑润和提取(SET)的推算效能较高的新技术,并与传统的纵向分析步骤进行了比力。
以番茄为试验资料,选取基于性状的滑润和提取(SET)和纵向分析步骤,钻研了接种丛枝菌根真菌(AMF)的泥土中锌(Zn)的增长和成长植物对植株成长的影响。从基于性状的滑润和提取(SET)的分析和纵向分析得到的结论是类似的,只管前者的分析了局有更显著的差距。了局批注,增长锌对接种泥土中成长的植株影响不大,但成长取决于未接种泥土中增长锌的量。对未滑润数据的纵向分析切合一个混合模型,该模型蕴含固定的和随机的样条回归模型,并思考了功夫点之间的不等方差和自有关。
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未滑润的投影面积(PSA)和成长速度的剖面图。

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基于性状的滑润和提取(SET)的分析了局,显示所选DAPs和功夫距离的预测sPSA(a)、sPSA AGR(b)和sPSA RGR(c)。

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观测值的中值误差减去滑润的PSA值。

基于性状的滑润和提取(SET)的分析可用于任何可能利用传统纵向分析的情况,出格是当有很多观测功夫点时。部署基于性状的滑润和提取(SET)的步骤的两个原因:(i)必要生物学上有关的成长参数来简约地描述成长,通常着眼于少数几个区间,(ii)必要推算效能高的步骤,以便更容易实现有效的分析,同时依然捉拿到所展示的成长动力学的根基特点。本文还会商了传统纵向分析必要思考的统计模型,并证了然有效的纵向分析可能必要时时忽略的不等方差和自有关。关于主观选择数学增长函数或样条曲线以表征增长的独立问题,建议对基于性状的滑润和提取(SET)的分析和纵向分析,均应选取基于证据的法式。

起源:Plant Methods.Smoothing and extraction of traits in the growth analysis of noninvasive phenotypic data.Chris Brien, Nathaniel Jewell, Stephanie J. Watts-Williams, Trevor Garnett & Bettina Berger.https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-020-00577-6

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